好氣性發(fā)酵過程中泡沫的形成是有一定規(guī)律的。泡沫的多少一方面與通風、攪拌的劇烈程度有關，攪拌所引起的泡沫比通氣來得大；另一方面與培養(yǎng)基所用原材料的性質有關，蛋白質原料如蛋白胨、玉米漿、黃豆粉、酵母粉等是主要的起泡因素。通常，培養(yǎng)基的配方含蛋白質多，濃度高，粘度大，容易起泡，且泡沫多而持久穩(wěn)定。膠體物質多、粘度大的培養(yǎng)基更容易產生泡沫，如糖蜜原料與石油烴類原料，發(fā)泡能力特別強，泡沫多而持久穩(wěn)定。多糖的水解不完全，糊精含量多，也容易引起泡沫的產生。培養(yǎng)基的滅菌方法和操作條件均會影響培養(yǎng)基成分的變化而影響發(fā)酵時泡沫的產生。因此可見，發(fā)酵過程中泡沫形成的穩(wěn)定性與培養(yǎng)基的性質有著密切的關系。

在發(fā)酵過程中培養(yǎng)液的性質，因微生物的代謝活動而處于運動變化中，也會影響泡沫的形成和消長。例如，霉菌在發(fā)酵過程中的代謝活動所引起的培養(yǎng)液液體表面性質變化直接影響泡沫的消長。發(fā)酵初期，由于培養(yǎng)基濃度發(fā)，粘度高，營養(yǎng)料豐富，因而泡沫的穩(wěn)定性與高的表面黏度和低的表面張力有關。隨著發(fā)酵進行，表面黏度下降，表面張力上升，泡沫壽命逐漸縮短。另外，菌的繁殖，尤其是細菌本身具有穩(wěn)定泡沫的作用，在發(fā)酵最旺盛時泡沫形成比較多，在發(fā)酵后期菌體自溶導致發(fā)酵液中可溶性蛋白質增加，又有利于泡沫的產生。此外，發(fā)酵過程中污染雜菌而使發(fā)酵液黏度增加，也會產生大量泡沫。

微生物工業(yè)上消除泡沫常用的方法有兩種：化學消泡和機械消泡。